1999年，经过清理整顿之后，疯狂投机的期货市场终于安静下来，众多交易所被合并成了大连、上海和郑州三家。郭晓利在11月被调任大商所专管交易、交割和结算的副总裁，并出色地完成了管理工作。近两年来，期货市场复苏的步伐加快，成交量和持仓量大增，而股票市场却相对低迷，致使期市再度成为媒体关注的焦点之一。而作为国内最有影响力的交易所，大商所的大豆期货又成为期市热钱追逐的目标，直至2002年在五月合约上再度出现多空对峙，最后以78万吨大豆完成巨量交割的年度期货界大事。但大商所严格按照相关规章制度监管市场，不偏不倚不干预，使多空双方都能理性对待交易和交割，从而平稳地度过了巨量持仓交割这一大关。
在那一个月，作为主管副总裁，功不可没的郭晓利没少费心。但郭晓利毕竟是郭晓利，他经历的风雨太多了，所以面对五月合约的巨量仓单，他并没有惊慌失措。据和郭晓利共事多年的中期副总裁党剑先生回忆，那时他曾担心出事，给郭晓利打电话询问。结果发现，郭晓利一点没慌，只是告诉党剑，他已经派了最得力的一个部门经理，专门监督交割库大豆仓单，确保没有不符合标准的大豆混入。郭晓利对党剑说，我只认规定，多空双方愿意交割多少就交割多少，但我要把的是交割大豆的品质这一关，决不允许假冒伪劣产品混入交割库＂。事后，他对自己的所作所为却绝口不提，只对笔者表示，这次交割与以前相比，之所以能平稳完成，主要是因为现在的期货市场规范了，投资者边的理性了。他对记者说：＂其实早在1994年10月，针对当时存在的不规范操作等现象，我写了《期货交易的理性运作》，倡导理性投资。那时候，我们组织起基本面客户队伍，在1994年11月北京商品交易所绿豆期货、1995年3月郑州商品交易所绿豆向下偏离基本面时建议客户大量入市买进，而在1995年6月当天津联合期货交易所红豆期货、1995年7月大连商品交易所玉米期货向上偏离基本面时建议客户大量入市卖出，每一次运作客户都获利丰厚。同时，我们也对投资者进行风险教育，规劝客户理性投资，当有两个停板的盈利时一定出场，得饶人处且饶人，要考虑整个市场的长远发展，大河不干小河才能有水。去年5月时，我对多空双方主力和普通投资者说的依然是这个道理。＂
在郭晓利眼里，期货报国是她多年来的梦想，所以要实现这个梦想，就必须有一个规范的期货市场。他说，在日本时他就深深感受到了期市不规范所带来的负面影响，回国着这些年对此的体验更深，所以他痛恨不规范行为，认为不规范的市场既无法实现期货的功能，又无法给投资者提供一个公平公开公正的投资环境，所以迟早得关张大吉。这，将会从根本上影响期货市场的前途，甚至会影响到我国粮食市场、资本市场的改革大计。
＂期货市场要像延续现在的繁荣势头，就必须坚持规范监管、规范运作和规范投资的原则，在监管者、经纪公司和投资者三者之间，必须有合乎规范的联络纽带。惟其如此，我国的期货市场才有大的发展，这是我进入期货市场15年来最深刻的感受。＂郭晓利说。
而对于近期被媒体报得沸沸扬扬的天然胶和大豆的涨跌，郭晓利认为，应该看淡涨跌，而把注意力集中在期货市场运作是否规范这件事上。他说：＂期货市场中的品种涨跌很正常，只有这样，期货市场才能发挥它价格发现、套期报纸等功能。如果没有了涨跌，期市就变成了死水一潭，何来期市繁荣，何来市场经济？＂他告诉记者，他现在刚刚出了一本名为《转轨时期的中国期货市场》的书，把他15来发表的论文做了一次汇总。而且，他还想把自己对期市价格波动的一些思考从理论上加以总结，也汇总到书里。＂也许来不及了，但下一次出书是我一定把这个内容加进去＂，郭晓利说。